L’Hôpital du Mali a pour mission de participer à la mise en œuvre de la politique nationale de santé. A cet effet, il est chargé de :

• assurer le diagnostic, le traitement des malades, des blessés, des femmes enceintes et des enfants ;
• prendre en charge les urgences et les cas référés ;
• participer à la formation initiale et assurer la formation continue des professionnels de la santé ;
• conduire des travaux de recherche dans le domaine médical.

En plus de ses objectifs statutaires, l’Hôpital du Mali a aussi comme vocation la diminution des évacuations sanitaires vers l’extérieur du pays, notamment en Endocrinologie, en Neurochirurgie, en Chirurgie thoracique et en radiothérapie.